Wir befinden uns in der Edo-Periode des alten Japan. In der Hauptstadt herrscht das Shogunat wobei Aliens, von der Rasse der Amanto die eigentlich Drähtezieher sind. In dieser Stadt verdient sich der ehemalige Freiheitskämpfer Gintoki, zusammen mit der Brille Shinpachi und der gewaltätigen Kagura als Yorozuya seine Brötchen. Als solcher sollte er eigentlich für Geld jeden Job erledigen, wobei ihm das nicht immer leicht fällt, vor allem, da er sich nebenher immer mit vielen schrägen Gestalten herumschlagen muss. Da wäre zum einen der überdimensionale Hund Sadaharu; Gintokis alter Freund Zura (janai, Katsura da!)und dessen "Haustier" Elizabeth; die Shinsengumi (Eine Art "Polizei" der Stadt Edo),die von einem Gorilla, einem Mayonaise-Freak und einem Sadisten angeführt werden; die masochistische Sarutobi, die von Gin-chan dominiert werden will; Hasegawa, der wegen seiner Nutzlosigkeit auch oft Madao genannt wird (Was für alle möglichen Kombinationen von schlechten Eigenschaften stehen kann) und noch viele andere Leute, Amanto und Dinge, die ihm, so scheint es, das Leben schwer machen.